Ξεπαγώστε τις σφολιάτες. Κόβουμε τα κρεμμύδια σε λεπτές φέτες. Ζεσταίνουμε το ελαιόλαδο σε ένα τηγάνι. Ριχνουμε Τα κρεμμύδια με το αλάτι και το τηγανίζουμε σε καυτό λάδι σε μέτρια φωτιά σε 8-10 λεπτά να μαλακώσουν, ριχνουμε και το μελι και αποσυρουμε απο την φωτια το τηγανι.
Καθαριζουμε τα φύλλα του θυμαριού από τα κοτσάνια και ψιλοκόβουμε. Σε μια φορμα η ταψί (περίπου 39 x 32 εκ.) καλυπτουμε με λαδόκολλα και βαζουμε επανω τις σφολιατες τη μια επανω στην άλλη.
Πιέστε τη ζύμη γύρω γυρω στις άκρες να ενωθουν καλα, τρυπαμε τη ζύμη με ένα πιρούνι αρκετές φορές. Αλείψτε τη σφολιατα με την κρέμα, πασπαλιζουμε με αλάτι και πιπέρι και το Θυμάρι.
Ριχνουμε επανω στην κρεμα και τα κρεμμύδια αφήνοντας απο την ζυμη 1 εκατοστό ελεύθερο και πασπαλίζουμε με την πάπρικα και το πιπέρι καγιέν.
Ψήνουμε σε ένα ζεστό φούρνο στους 220 βαθμούς στο μεσαίο ράφι για 20-25 λεπτά.